從圖1可以看出，企業的職責是制定監測計劃，進行全年監測，年度報告碳排放結果，接受第三方核查機構的核查；第三方核查機構對企業碳排放進行核查，提交核查報告給碳交易主管部門，對企業的監測計劃提出改進建議。在合規鏈中有兩個政府部門，一個是碳交易主管部門，負責企業監測計劃的批準，檢查全年監測計劃的實施，根據核查結果對退回配額進行合規檢查；另一個政府部門是統一的國家認證認可監管部門，對核查機構進行認可和監督。

　　歐盟采用國際標準化組織制定的標準ISO/IEC17011：2004《合格評定認可機構的一般要求》，對認可機構進行同行評價；采用ISO 14065：2007《溫室氣體：溫室氣體審定和核證機構要求》，對核查機構進行認可管理。歐盟碳交易相關指令、法規、MRV標準和指南文件之間的關系如圖2所示。

　　歐盟內每個國家有一個國家的認可機構，采用國際通行的認可手段對核查機構的能力進行確認并認可，國家認可機構之間進行同行評審，相互承認認可結果以及核查數據。