國家政策、專家和環保NGO均指出，煤制氣的盲目過快發展給中國水資源安全和節能減排帶來巨大挑戰。煤制氣產業自2013年因《大氣污染防治行動計劃》、《天然氣發展“十二五”規劃》等利好政策吸引了大量投資，產煤區紛紛上馬煤制氣項目。然而，由于其高耗水，高煤耗，污染處理技術以及碳排放等問題，煤制氣的過快發展引起了能源專家和業內人士的質疑和討論。據統計，包括計劃中的，我國約有50個煤制氣項目，其中46個分布在缺水且生態脆弱的西北地區，大規模發展煤制氣將加劇當地的水資源危機。林伯強指出，煤制氣只是轉移了污染排放，并未改變能源結構。綠色和平上周發布報告稱中國煤制氣項目若全部建成投產，其產生的碳排放將超過美國2020年前減排總額（3.96億噸），而中國節能減排應對氣候變化的努力也會付之流水。近日國家能源局出臺《關于規范煤制油、煤制天然氣產業科學有序發展的通知》，以規范煤制氣項目發展。但是，此前投資煤制氣產業的企業已經因巨大損失而相繼撤離。

       煤炭行業持續低迷，煤企虧損面達七成。中國煤炭工業協會指出，由于煤炭供大于求，庫存居高不下；同時煤炭價格大幅下滑，企業虧損面進一步擴大。目前已有一半以上的企業職工工資下滑，部分企業出現了緩發、減發、欠發工資的情況。

       發展煤制氣僅是權宜之計而非戰略之策。煤制氣雖然可以降低大氣污染物排放，部分緩解我國天然氣供應壓力，但是從全生命周期過程來看，煤制氣的一次能源消耗和二氧化碳排放均高于傳統能源和技術，此外在水資源消耗和污染物排放方面，煤制天然氣也沒有明顯優勢。綠色和平分析指出，全國50個已有或在建、計劃中煤制氣項目，八成項目量位于西北地區，大規模發展煤制氣將加劇當地水資源危機；同時，造成一地治霾，全國增煤耗和碳排放的局面。

       我國煤炭環境的外部成本巨大，煤炭環境污染導致健康損失超三千億。由于我國煤炭價格沒有充分反映煤炭的環境外部成本，導致煤炭的生產利用環節造成的環境問題持續惡化。根據《煤炭環境外部成本核算及內部化方案研究》報告，2010年煤炭環境總成本是5555.4億元。其中，大氣污染造成人體健康損失和礦區職工健康損失最大，兩項共計3051億元。