方法學是指用于確定項目基準線、論證額外性、計算減排量、制定監測計劃等的方法指南。截止到2014年4月18日，國家發改委已在信息平臺分四批公布了178個備案的CCER方法學，其中由聯合國清潔發展機制（CDM）方法學轉化173個，新開發5個；含常規項目方法學96個，小型項目方法學78個，林業草原項目方法學4個。這些方法學已基本涵蓋了國內CCER項目開發的適用領域，為國內的業主企業開發自愿減排項目提供了廣闊的選擇空間。

額外性是指項目活動所帶來的減排量相對于基準線是額外的, 即這種項目及其減排量在沒有外來的CCER項目支持情況下, 存在財務效益指標、融資渠道、技術風險、市場普及和資源條件方面的障礙因素, 依靠項目業主的現有條件難以實現。

如果所評估項目符合方法學的適用條件并滿足額外性論證的要求，咨詢機構將依照方法學計算項目活動產生的減排量并參考碳交易市場的CCER價格，進一步估算項目開發的減排收益。CCER項目的開發成本，主要包括編制項目文件與監測計劃的咨詢費用以及出具審定報告與核證報告的第三方費用等。項目業主以此分析項目開發的成本及收益，決定是否將項目開發為CCER項目并確定每次核證的監測期長度。