項(xiàng)目活動(dòng)的監(jiān)測是項(xiàng)目參與方按照項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件所詳細(xì)描述的監(jiān)測計(jì)劃，在項(xiàng)目活動(dòng)的執(zhí)行過程中，對(duì)有關(guān)溫室氣體減排的所有資料、參數(shù)等進(jìn)行有目的、定期、可復(fù)查的記錄、收集和歸檔。按UNFCCC的定義，監(jiān)測是『為決定基準(zhǔn)線、測量某CDM項(xiàng)目邊界內(nèi)的溫室氣體人類性排放和可適用的泄露，對(duì)全部的有關(guān)資料進(jìn)行收集和存檔』。因此，注冊項(xiàng)目之前監(jiān)測計(jì)劃需要得到CDM執(zhí)行理事會(huì)的批準(zhǔn)。如同基準(zhǔn)線方法學(xué)，監(jiān)測方法也存在正常的『已批準(zhǔn)監(jiān)測方法學(xué)』和適用于小規(guī)模項(xiàng)目活動(dòng)的『簡化監(jiān)測方法學(xué)』。CDM的模式和程序允許項(xiàng)目參與方對(duì)監(jiān)測計(jì)劃進(jìn)行不時(shí)的修改，但有關(guān)修改需要由DOE審定，并且有關(guān)監(jiān)測計(jì)劃的修改應(yīng)在簽發(fā)CERs之前由項(xiàng)目參與方完成及DOE審定。

       核查是由『指定經(jīng)營實(shí)體』按正式的程序?qū)λO(jiān)測的溫室氣體減排進(jìn)行定期和獨(dú)立的檢查和事后的確認(rèn)。核證則是『指定經(jīng)營實(shí)體』出具書面文件，保證特定項(xiàng)目活動(dòng)實(shí)現(xiàn)了所核查的溫室氣體減排量。核查的要點(diǎn)包括：檢查監(jiān)測報(bào)告是否滿足了已注冊批準(zhǔn)的項(xiàng)目設(shè)計(jì)文件中的條件要求；檢查監(jiān)測方法學(xué)是否得到了準(zhǔn)確的運(yùn)用；如需要的話，執(zhí)行現(xiàn)場檢查或要求項(xiàng)目開發(fā)者提供更多的信息資料；給項(xiàng)目開發(fā)者推薦計(jì)入期內(nèi)任何可能的監(jiān)測修改及調(diào)整；最后決定CDM項(xiàng)目活動(dòng)所產(chǎn)生的溫室氣體實(shí)際減排量。

       項(xiàng)目參與方需從DOE名單中選擇一家機(jī)構(gòu)來進(jìn)行項(xiàng)目的核查和核證，并給相關(guān)DOE提交監(jiān)測報(bào)告。UNFCCC的官方文件中沒有要求監(jiān)測結(jié)果的更新頻率，但當(dāng)前大多數(shù)項(xiàng)目開發(fā)者和參與方的通常做法，是每一年或者每半年完成一次監(jiān)測報(bào)告，交由DOE進(jìn)行核查。然后，DOE把監(jiān)測報(bào)告制作成PDF格式并直接公布在UNFCCC的CDM網(wǎng)站上，標(biāo)明監(jiān)測時(shí)段的起始日期。接著，DOE正式執(zhí)行核查并出具核查報(bào)告。在核查報(bào)告的基礎(chǔ)上，出具書面的溫室氣體減排的核證文件。最后，DOE會(huì)完成一份核查報(bào)告和一份核證報(bào)告并對(duì)外公開。核證報(bào)告中需聲明所核查的溫室氣體實(shí)際減排量。

       一旦完成核查與核證程序，項(xiàng)目參與方就可以開始推動(dòng)CERs的簽發(fā)。首先，DOE應(yīng)使用『遞交檢查與核證報(bào)告及提請簽發(fā)的CDM表格』,連同完成的核查、核證報(bào)告，通過UNFCCC的CDM網(wǎng)站上的特定電子提交工具，發(fā)送給執(zhí)行理事會(huì)秘書處。

       秘書處正式受理后15天內(nèi)，除非項(xiàng)目活動(dòng)涉及方或至少3個(gè)執(zhí)行理事會(huì)委員提出審查，執(zhí)行理事會(huì)將指示CDM注冊官簽發(fā)特定時(shí)段具體數(shù)量的CERs，同時(shí)會(huì)告知項(xiàng)目參與方，并對(duì)外公布于UNFCCC的CDM網(wǎng)站上。

       如果執(zhí)行理事會(huì)拒絕簽發(fā)CERs的理由可通過修改核查核證報(bào)告等手段來解決，那么DOE還可以修改監(jiān)測報(bào)告，并提請對(duì)同一時(shí)間內(nèi)的CERs作第二次簽發(fā)，執(zhí)行理事會(huì)則會(huì)在下次會(huì)議中個(gè)案決定。如再次被拒，則沒有可能第三次提請簽發(fā)CERs。

       按照CDM項(xiàng)目模式和程序的規(guī)定，每次簽發(fā)CERs時(shí)作為CDM管理費(fèi)用的『收益分配』應(yīng)當(dāng)完成，CERs的簽發(fā)才算生效。當(dāng)然，項(xiàng)目注冊時(shí)已經(jīng)繳納的『預(yù)付』注冊費(fèi)應(yīng)當(dāng)從中扣除。另外，所有CERs的2%部分將自動(dòng)扣除劃撥到一個(gè)特殊賬戶，即所謂的『適應(yīng)收益分配』賬戶，為支持那些特別容易受到氣候變化危害的發(fā)展中國家提供資金。在最不發(fā)達(dá)國家境內(nèi)開發(fā)和執(zhí)行的CDM項(xiàng)目活動(dòng)，可以免除繳納此項(xiàng)費(fèi)用。