配額總量的多寡決定了配額的稀缺性，直接影響碳市場的配額價格。中國全國碳市場建設初期采取“先分配后定總量”的方法。根據國家發改委《碳排放權交易管理暫行辦法》的規定，首先國務院碳交易主管部門制定國家配額分配方案，明確各省、自治區、直轄市免費分配數量、國家預留的排放配額數量等；其次各省、自治區和直轄市向本行政區域內重點排放單位免費發放配額，其他剩余配額允許省級碳交易主管部門用于有償分配。配額總量控制需要根據國家和地區碳排放總量控制目標制定，同時需要兼顧考慮行業企業配額與國家產業政策、行業規劃的銜接，如考慮列入去產能、去庫存情況，一定程度上體現國家整體政策導向。