試點企業在獲得各年度碳排放配額后，即可通過本市碳交易平臺進行交易。試點企業持有的未來各年度的配額不得低于其通過分配取得的對應年度配額量的50%。

試點企業應于每年6月1日至6月30日期間，通過配額登記注冊系統提交與其經市發展改革委審定的上年度碳排放量相當的配額，履行清繳義務。用于清繳的配額為企業持有的上年度或此前年度的配額。配額不足的，應通過本市碳交易平臺購買補足。配額結余的，可在試點期間儲存使用。試點企業清繳的配額，由市發展改革委通過配額登記注冊系統注銷。

按照本方案發放的本市2013年至2015年碳排放配額在2016年6月30日前有效。下一階段的碳排放配額發放和使用，根據國家和本市碳排放交易工作安排另行確定。

試點企業可以將國家核證自愿減排量（ccer）用于配額清繳。用于清繳時，每噸國家核證自愿減排量相當于1噸碳排放配額，使用比例最高不得超過該年度通過分配取得的配額量的5%。